刑侦员兵分多路在死者家周边，以及黄桥镇进行拉网式排查，很快就发现了重要的线索。
孙晓明的两个亲戚在案发当天下午两点多曾去孙家送水果时，看见孙家还有三个客人。
孙家亲戚回忆：“那三个人年纪都不大，二十多岁的年纪，穿着打扮像做民工的，其中有一个小平头还十分面熟，可就是想不起来在什么地方见过。”
孙晓明的邻居李顺生对刑侦员说：“案发当天下午三点十五分左右，我听到孙晓明家有吵闹声，但是孙晓明和妻子经常因为赌博而吵架，所以我就没放在心上。”
还有一个叫叶莉的女邻居说：“案发当天三点半左右，我看到死者闫涛和吴林一人提了箱水果上楼，但我并没有见到他们进入孙家的景象。
刑侦员们将调查情况汇总后，秦仁杰分析：犯罪嫌疑人行凶的时间很可能分成两次，第一次就是下午三点十五分，当时杀害的是孙晓明和闫丽娇。
第二次则是三点三十分左右，闫涛和吴林来孙家送水果的时候。
孙晓明那两个送水果的亲戚长期在黄桥镇务农，虽然交际面不广，但是却觉得三个年轻人之一的小平头面熟，所以那个小平头很可能就是孙晓明雇佣的工人。
秦仁杰依据孙晓明那两名亲戚的描述，绘制了小平头的模拟画像，并且让杨颖去排查孙晓明通讯录里的电话号码，很快就锁定了犯罪嫌疑人，同是黄桥镇的闫三根。
闫三根在死者孙晓明的工地上做过工，还和孙晓明一起赌过钱，曾一夜之间输给孙晓明两万多元。
两万多元对于闫三根来说就是一笔巨款，就为这笔赌资，闫三根就有充分的杀人动机。
秦仁杰对闫三根调查得知。他在二十五日下午曾经外出，二十六日就带着一家人出了门，至今去向不明。
中秋节离家，这对手头拮据的闫三根来说有点反常，一切迹象显示闫三根有重大作案嫌疑。
二十八日早晨七点多钟，刑侦员找到了闫三根藏匿的地方。秦仁杰怕夜长梦多，立即命令将闫三根躲藏的地方包围起来，然后将其抓捕归案。
秦仁杰在闫三根的家里搜出了带有血迹的衣物。经法医鉴定，那些血迹属于死者孙晓明的。
闫三根见警方掌握了他大量的犯罪证据，心知大势已去，于是便放弃了狡辩，向秦仁杰如实交待了伙同闫天云，闫文华杀害孙晓明及其家人，并抢劫死者家中财物的犯罪事实。
秦仁杰得知另外两名犯罪嫌疑人的身份后，在闫三根被抓捕的消息还没有传出去之前，火速派武都警局的刑侦员实施抓捕行动？
刑侦员兵分两路，一路前往闫天云家，一路则直奔闫文华的住处，以迅雷不及掩耳之势将两名嫌疑人孤获。
闫天云和闫文华得知闫三根已经全部交代之后，哪里还敢负隅顽抗，只得低下头全部交代了自己犯下的罪行。
秦仁杰在审讯中得知，三名犯罪嫌疑人在半个月前，就曾经到孙晓明家准备实施犯罪，可碰巧那天孙晓明家来了一批客人，他们找不到作案的机会只得放弃。
九月二十九日凌晨两点，秦仁杰根据闫三根等三名犯罪嫌疑人交待的情况，连夜赶到武西区山枣镇的一个偏僻的山林里，找到了一个被遗弃的黑色提包。